在bash中加入文件时保留文件头。

我有2个标签分隔的文件。

fileA. tsv

probeId    sample1_betaval    sample2_betaval    sample3_betaval
   a              1                  2                  3
   b              4                  5                  6
   c              7                  8                  9

fileB.tsv

probeId       region      gene
   a         intronic      tp53
   b         non-coding     NA 
   c         exonic         kras

由于它们已经按probeId排序，我把两个文件合并了。

join -j 1 fileA.tsv fileB.tsv -t $'\t' > complete.tsv

问题是输出的文件没有保存头部。

   a              1                  2                  3           intronic    tp53
   b              4                  5                  6           non-coding   NA
   c              7                  8                  9            exonic      kras

而我想要的输出是:

probeId    sample1_betaval    sample2_betaval    sample3_betaval     region     gene
   a              1                  2                  3           intronic    tp53
   b              4                  5                  6           non-coding   NA
   c              7                  8                  9            exonic      kras

我怎么才能做到呢？

解决方案：

添加 --header 选项，如果您的加入提供了它。

join --header -j 1 fileA.tsv fileB.tsv -t $'\t' > complete.tsv